戦闘第161飛行隊

昭和19年8月10日，601空の下に編成．艦戦48機を定数とし，第3航空戦隊の「瑞鶴」以下空母4隻に分乗し比島沖海戦に参加．敵艦隊攻撃後に陸上基地に向かった一部を除き，人員機材共に空母沈没と同時に壊滅．11月15日解隊．

戦闘第162飛行隊

昭和19年8月10日，601空の下に編成．爆戦48機を定数とし，空母搭載を予定され松山基地で錬成を行った．比島作戦には間に合わず，11月15日付で解隊．

戦闘第163飛行隊

昭和19年8月10日，634空の下に編成．艦戦48機を定数とする戦闘機隊．徳島で錬成の後，10月鹿屋に進出し台湾沖航空戦に参加．台中経由クラークに進出し比島航空戦に参加したが潰滅．11月15日付で解隊．

戦闘第164飛行隊

昭和19年9月1日編成．653空．艦戦48機を定数とする戦闘機隊．大分で錬成の後，台湾沖航空戦に参加．一部は第3航空戦隊の4空母に搭載され比島沖海戦に参加．陸上基地からも比島航空戦に参加し消耗．11月15日付で解隊．

戦闘第165飛行隊

昭和19年8月1日編成．653空．艦戦48機を定数とする戦闘機隊．大分で錬成の後，一部は第3航空戦隊の4空母に搭載され比島沖海戦に参加．陸上基地からも比島航空戦に参加し消耗．11月15日付で解隊．

戦闘第166飛行隊

昭和19年8月1日編成．653空．定数爆戦48機，第3航空戦隊の4空母に搭載され比島沖海戦に参加．敵艦隊攻撃後陸上基地に向かい，レイテ作戦に参加．11月15日付で解隊．

戦闘第167飛行隊

昭和19年8月10日編成．634空．艦戦48機を定数とする戦闘機隊．徳島で錬成の後，10月鹿屋に進出し台湾沖航空戦に参加．さらにクラークに進出し比島航空戦に参加．11月15日付で解隊．

戦闘第301飛行隊

昭和19年3月，202空飛行隊を改編．艦戦48機を定数としトラック防空に従事．6月ビアク，マリアナ作戦に参加．7月201空に転属．比島戦．11月252空，12月343空(2代)に配属され紫電改で再建．沖縄戦などに参加し終戦で解隊．

戦闘第302飛行隊

昭和19年4月，252空飛行隊を改編．艦戦48機を定数とし，6月の硫黄島上空の空戦で壊滅．10月台湾沖・比島航空戦に参加し，11月201空に転属．台湾に後退後の2月に205空に編入され特攻を主として沖縄戦に参加．終戦で解隊．

戦闘第303飛行隊

昭和19年4月，203空飛行隊の半部から編成．203空に所属のまま8月まで千島防空に従事．9月鹿児島に移動，10月台湾沖・比島航空戦に参加．11月201空に転属．20年1月本土に帰還し203空に復帰．3月以降沖縄戦に参加し，築城で終戦を迎えた．

戦闘第304飛行隊

昭和19年4月，203空飛行隊の半部から編成．203空で9月まで千島防空．10月台湾沖・比島航空戦に参加．ルソン島バンバンを拠点に，一部がダバオに進出．11月221空に転属．20年3月，252空の下で再編．4月沖縄戦に短期間参加．茂原で終戦を迎えた．

戦闘第305飛行隊

昭和19年3月，201空飛行隊の半部から編成．ペリリューで消耗しダバオで再建．10月以降，特攻を含む米機動部隊への攻撃に従事．11月252空に転属．20年2月721空に転属し鹿屋に展開．3月18日の九州上空邀撃戦で壊滅し残存の隊員は20日に203空に転属．書類上4月に701空に移り5月解隊．

戦闘第306飛行隊

昭和19年3月201空飛行隊の半部で編成．4月比島に進出．9月の空襲で消耗，10月本土に帰還．11月721空に編入．20年3月富高に進出し九州沖航空戦で壊滅．26日に隊員は戦闘312に転出．4月末に爆戦特攻隊として再編．沖縄戦に参加し終戦で解隊．

戦闘第307飛行隊

昭和20年2月編成．721空所属で3月の九州沖航空戦に参加．消耗後の26日隊員は戦闘312に編入．以後も書類上で残っていたが5月解隊．

戦闘第308飛行隊

昭和19年7月編成．221空．12月ルソン島に進出するも壊滅．20年2月252空に転属し再建．関東上空での邀撃に参加．3月601空に編入され4月初旬から短期間沖縄戦に参加．関東に戻った後，7月奈良県大和基地に移動し終戦．

戦闘第309飛行隊(初代)

昭和19年4月253空の飛行隊から編成．トラック邀撃，マリアナ航空戦に参加．マリアナで消耗し，7月253空と共に解隊．

戦闘第309飛行隊(二代)

昭和19年10月，331空飛行隊を改編して編成．南西方面で活動．20年2月シンガポール，5月九州に移動し203空に転属．終戦で解隊．

戦闘第310飛行隊(初代)

昭和19年4月253空の飛行隊から編成．トラック邀撃，マリアナ航空戦に参加．マリアナで消耗し，7月253空と共に解隊．

戦闘第310飛行隊(二代)

昭和20年2月601空戦闘機隊を改編．601空に所属し，硫黄島特攻・沖縄戦・関東防空に従事．鈴鹿基地で終戦．

戦闘第311飛行隊

昭和19年4月381空・202空搭乗員を主体にケンダリーで編成．381空に所属．5月153空に転属．ビアク作戦で消耗．7月201空に転属．比島航空戦．12月252空に転属，本土で再建．3月203空，4月701空に転属し沖縄戦に参加．5月203空に戻り終戦で解隊．

戦闘第312飛行隊

昭和19年7月221空飛行隊から編成．8月台湾に進出．10月台湾沖・比島航空戦に参加．20年3月203空に転属しルソン島から九州に後退，九州沖・沖縄航空戦に参加．7月築城に後退．終戦で解隊．

戦闘第313飛行隊

昭和19年7月221空飛行隊から編成．10月ルソン島に進出，20年1月まで比島航空戦に参加．2月252空に転属し本土で再建．3月末に国分に進出，沖縄戦に参加．4月中旬関東に後退．5月752空，7月203空に転属．終戦で解隊．

戦闘第315飛行隊

昭和19年7月252空の下に編成．館山で錬成．10月台湾沖航空戦に参加した後ルソン島に進出．12月201空，221空に相次いで転属し台湾に後退．3月205空に編入され沖縄戦に参加．終戦で解隊．

戦闘第316飛行隊

昭和19年3月編成．301空．零戦による夜間攻撃隊を目指したが，通常の戦闘機隊として6月マリアナ戦に投入され潰滅．7月252空の下で再建．10月台湾・比島に進出．11月本土に帰還．3月から沖縄戦に参加．4月茂原で再建．7月郡山に移動．終戦で解隊．

戦闘第317飛行隊

昭和19年7月編成．252空．10-12月硫黄島に派遣隊を出し．11月には第1御楯隊がサイパンに突入．本隊は10月台湾・比島に進出．11月201空に転属．台湾に後退後の2月に205空に転属，沖縄戦に参加．終戦で解隊．

戦闘第318飛行隊

昭和20年4月11空の人員を主体に381空の下で編成．5月末に解隊．人員機材は381空に転属．

戦闘第351飛行隊

昭和19年3月，トラック空襲で壊滅した501空爆戦隊を基に編成．同月20日に一部がペリリューに進出するも月末の空襲により潰滅．残りはダバオで錬成を行っていたが7月解隊．搭乗員は201空に編入された．

戦闘第401飛行隊

昭和19年7月341空の下に新編．紫電装備で9月高雄に，10月ルソン島に進出．20年1月台湾に後退し本土に帰還．343空に転属し紫電改に改変．若年搭乗員の錬成を行った．終戦で解隊．

戦闘第402飛行隊

昭和19年7月341空の下に新編．紫電と零戦を併用して10月宮崎からルソン島に進出．1月本土に帰還．2月343空，3月601空に転属．沖縄戦に参加．5月筑波空に転属し関東防空に従事．終戦で解隊．

戦闘第403飛行隊

昭和20年5月谷田部空紫電隊を基に新編．筑波空に所属．紫電装備で関東防空に従事．終戦で解隊．

戦闘第407飛行隊

昭和19年3月221空で編成．10月ルソン島に進出．比島航空戦で消耗し12月本土に帰還し343空に転属．紫電改に改変し3月以降沖縄航空戦等に参加．終戦で解隊．

戦闘第601飛行隊

昭和19年3月301空の下で編成．当初「雷電」装備だったが零戦に転換し6月硫黄島に前進．6月下旬と7月上旬の米空母機邀撃戦で壊滅．7月解隊．

戦闘第602飛行隊

昭和19年4月ケンダリ―にて381空飛行隊から編成．381空に所属．南西方面の作戦，特にバリクパパン防空に従事．20年3月シンガポールへ，4月上旬本土に移動．5月解隊．

戦闘第603飛行隊

昭和19年3月331空飛行隊から編成，202空に配属されメレヨンに進出．4月トラック，5月ソロンへ移動．6月ビアク戦に参加後ヤップ島で邀撃．7月ダバオで解隊．

戦闘第701飛行隊

昭和19年7月横須賀空で編成の紫電隊．T部隊の戦闘機隊として10月762空に編入．341空紫電隊と共に台湾沖，比島航空戦に参加．12月本土に帰還し343空に編入．沖縄航空戦等に従事．終戦で解隊．

戦闘第804飛行隊

昭和19年3月322空の下に編成の夜戦隊．7月141空に転属．10月台湾沖・比島航空戦に参加．11月153空に編入．20年1月本土に帰還し北東空に編入．3月131空に転属し芙蓉部隊の1隊として沖縄戦に参加．終戦で解隊．

戦闘第812飛行隊

昭和19年10月第51航空戦隊司令部付属夜戦隊を改編．203空に編入．11月153空に編入．S901と交代してルソン島に進出．比島航空戦に参加．1月内地に帰還．2月752空，3月131空に編入．芙蓉部隊の1隊として沖縄戦に参加．終戦で解隊．

戦闘第851飛行隊

昭和19年7月新編．131空に編入．香取を拠点とし，7月硫黄島に一部を派遣．11月北東空に編入され千歳に移動．20年1月153空に編入．台湾に進出．2月133空に編入され台湾から沖縄戦に参加．6月132空に転属．7月解隊．

戦闘第901飛行隊

昭和19年3月トラックの251空飛行機隊を改編．7月153空に編入されダバオに移動．9月以降比島航空戦に参加．11月752空に転属，内地に帰還．20年1月203空，2月752空，3月131空へ転属し芙蓉部隊の1隊として沖縄戦に参加．終戦で解隊．

戦闘第902飛行隊

昭和19年4月381空夜戦隊を改編．南西方面，特にバリクパパン防空や対潜哨戒に従事．20年5月九州へ移動し352空に転属．大村・築城から関門海峡の機雷投下に飛来するB29の邀撃等を行った．終戦で解隊．

攻撃第1飛行隊

昭和20年2月601空艦爆隊を改編．改編直後の硫黄島特攻，4月の沖縄作戦に参加．8月本土東方の米艦隊攻撃を実施．終戦で解隊．

攻撃第3飛行隊

昭和19年3月，541空飛行機隊を基幹に編成．541空．7月762空，10月763空に編入．台湾沖・比島航空戦で壊滅．20年1月131空に転属し再建．3月252空に編入され沖縄戦に参加．7月601空に編入され挙母基地で終戦．

攻撃第5飛行隊

昭和19年7月523空の残存兵力と横須賀空艦爆隊を基幹に編成．752空．彗星で台湾沖・比島航空戦に参加．11月761空．20年1月701空に編入され流星で再建開始．2月131空．5月752空．関東沖の機動部隊攻撃に従事．終戦で解隊．

攻撃第102飛行隊

昭和19年4月，553空艦爆隊を改編．553空．8月502空，10月701空に転属．九九艦爆次いで彗星で台湾沖・比島航空戦に参加．12月761空．20年初め台湾に後退．1月765空に編入され沖縄戦に参加．終戦で解隊．

攻撃第103飛行隊

昭和19年4月，502空艦爆隊を改編．502空．10月701空に転属．九九艦爆で台湾沖・比島航空戦，彗星で九州沖・沖縄航空戦に参加．8月15日，宇垣長官と共に特攻出撃したことで有名．終戦で解隊．

攻撃第105飛行隊

昭和19年3月，501空艦爆隊と552空を基幹にトラックで編成．501空．7月761空に編入．比島航空戦で消耗．11月内地に帰還し131空に，2月701空に転属．3月の九州沖航空戦で消耗．終戦で解隊．

攻撃第107飛行隊

昭和19年3月503空飛行機隊を基幹にサイパンで編成．引き続き503空に所属．6月ビアク島攻撃・マリアナ航空戦で消耗．サイパン残留の隊員は地上戦にて玉砕．7月解隊．

攻撃第254飛行隊

昭和20年2月，香取基地にて601空艦攻隊を改編．3月131空に転属し中旬に横芝陸軍飛行場へ移動．3月末に串良へ派遣隊を出し「天山」による夜間雷撃を実施．7月上旬第2鈴鹿に移動．終戦で解隊．

攻撃第256飛行隊

昭和19年5月，752空館山派遣隊を改編．752空．6月硫黄島に派遣隊．8月木更津，10月香取に移動．台湾沖・比島航空戦に参加．11月761空．20年1月701空に転出し香取に帰還．2月131空に転出．3月末に香取から串良へ派遣隊を出し沖縄戦に参加．

攻撃第262飛行隊

昭和19年8月1日，601空艦攻隊として新編．「天山」装備．9月T部隊に編入．10月762空．台湾沖・比島航空戦に参加．11月本土に帰還し「銀河」に改変．20年3月梓特別攻撃隊主力としてウルシー泊地を攻撃．九州沖・沖縄航空戦に参加．6月解隊．

攻撃第401飛行隊

昭和19年7月521空錬成員等を基幹に香取で編成の「銀河」隊．761空．10月初旬にルソン島に進出，索敵哨戒で消耗し，11月752空に編入され本土に帰還．20年1月下旬に台南に進出．新設の765空に編入され沖縄戦，ルソン島偵察などに従事．終戦で解隊．

攻撃第405飛行隊

昭和19年3月，新編の524空の飛行隊として編成の「銀河」隊．7月762空に，10月新編の763空に編入．台湾沖・比島航空戦に参加．20年1月関東に帰還し752空の下で再建．3月新編の706空に転属，沖縄航空戦に参加．台湾でレイテ攻撃準備中に終戦．

攻撃第406飛行隊

昭和19年7月解隊した522空を基幹に編成の「銀河」隊．762空．10月763空に転属．台湾沖・比島航空戦に参加し壊滅．11月中旬にK405に吸収された．同時に出水の763空訓練隊が新たなK406を再建．20年1月701空，2月762空．沖縄航空戦に参加．6月解隊．

攻撃第501飛行隊

昭和19年7月編成．横須賀空所属の「銀河」隊．9月752空に編入．台湾沖航空戦で壊滅．11月762空に編入され比島に進出．同月下旬に本土に帰還し20年1月までサイパン攻撃．1月九州に進出し九州沖・沖縄航空戦．大社基地で終戦．

攻撃第701飛行隊

昭和19年3月，755空と751空の飛行隊を基幹にテニアンで編成の陸攻隊．755空に所属．5月トラックに進出．7月755空と共に解隊．

攻撃第702飛行隊

昭和19年4月701空の陸攻隊が独立．701空所属で美幌に展開．10月752空に転属し台湾沖・比島航空戦に参加．20年1月頃763空に転属し台湾に後退．2月新編の765空に編入，ルソンや沖縄への攻撃を実施．終戦で廃止．

攻撃第703飛行隊

昭和19年4月752空の陸攻隊を改編．752空．6月硫黄島に進出．10月762空．台湾沖航空戦．11月マリアナ爆撃・比島航空戦．12月801空．夜間哨戒に従事．20年3月偵察第703飛行隊に改称．

攻撃第704飛行隊

昭和19年3月755空と751空の錬成員で編成．751空所属．ペリリュー．7月761空．9月ペリリュー・モロタイ攻撃．10月台湾沖・比島航空戦．11月752空，木更津で再建．マリアナ・硫黄島攻撃．3月706空．沖縄航空戦．6月以降「剣」作戦準備．終戦で解隊．

攻撃第705飛行隊

昭和19年4月753空陸攻隊を改編．753空に所属し5月ソロンに進出．ニューギニア航空戦に参加．6月ペリリューに移動しマリアナ航空戦に参加．7月753空と共に解隊．

攻撃第706飛行隊

昭和19年3月705空陸攻隊を改編．755空に所属しトラックを拠点に哨戒に従事．3月9日にはブラウン泊地攻撃を成功させた．5月グアムに後退，6月以降マリアナ航空戦に参加．7月755空と共に解隊．

攻撃第707飛行隊

昭和19年5月732空陸攻隊を改編．732空に所属しニューギニア航空戦に参加．6月中旬にペリリュー，下旬トラックに進出してマリアナ航空戦に参加．7月732空と共に解隊．

攻撃第708飛行隊

昭和19年7月762空陸攻隊を改編．762空に所属しT攻撃部隊の一部として台湾沖航空戦に参加．11月中旬からクラークに進出し比島航空戦に参加．12月本土に帰還し721空に編入．沖縄戦では桜花特攻に従事．小松で終戦．

攻撃第711飛行隊

昭和19年11月721空陸攻隊を改編．721空所属で桜花特攻の準備を行い，2月中旬鹿屋に進出．3月21日の初出撃で壊滅．以後，神雷部隊の錬成を担い5月解隊．

偵察第3飛行隊

昭和19年3月編成．新設の141空に配属．二式艦偵・彩雲で台湾沖・比島航空戦．11月701空(2代)，20年2月801空に編入．3月一式陸攻装備の夜間哨戒隊に改編，偵察第707飛行隊に改称．

偵察第4飛行隊

昭和19年7月開隊．141空．二式艦偵で台湾沖航空戦・比島航空戦に参加し消耗．台湾に撤退後の20年2月343空に編入，彩雲に機種改変し奇兵隊と称した．5月新編の171空に配属され，沖縄方面の索敵に従事．終戦で解隊．

偵察第11飛行隊

昭和19年7月開隊．新編の131空に配属．9月彩雲でマリアナ偵察．10月762空に転属．台湾沖・比島航空戦に従事．20年3月801空，5月171空に転属．沖縄航空戦に従事した．終戦で解隊．

偵察第12飛行隊

昭和19年10月，転出した偵察第11飛行隊の残存隊員を基幹に131空隷下に新編．11月752空に転出．彩雲装備でマリアナ偵察や第1御楯特別攻撃隊の誘導に従事．20年1月141空に転属．台湾に進出．2月新編の132空に編入．沖縄作戦に参加．終戦で解隊．

偵察第101飛行隊

昭和19年3月4日，トラック島にて151空飛行機隊を改編．引き続き151空所属で二式艦偵を装備．あ号作戦挺身偵察などに従事した．7月解隊．内地に帰還した隊員は偵察第4飛行隊に，トラック残留隊員は偵察第102飛行隊に編入された．

偵察第102飛行隊

昭和19年4月，153空陸偵隊を基幹にケンダリーで編成．153空に編入．7月121空・偵察101飛行隊を統合．11月141空に転属．比島航空戦に従事．20年1月752空に転属し内地に帰還．ウルシー・マリアナ偵察．終戦で廃止．

偵察第301飛行隊

昭和19年7月新編．横須賀空に配属の瑞雲隊．10月801空に転属．下旬にフィリピン・キャビテに進出．11月634空に転属し，634空の瑞雲隊と合同．20年1月台湾に後退．淡水と古仁屋を基地に沖縄戦に参加．終戦で解隊．

偵察第302飛行隊

昭和19年12月新編．801空に配属の水爆・水偵隊．20年3月以降，九州を拠点に古仁屋を前進基地として沖縄戦に参加．4月詫間空に転属．6月頃より634空司令の指揮下に入り，7月634空に転属．玄海基地で終戦を迎えた．

偵察第703飛行隊

昭和20年3月改称．沖縄戦に参加．一式陸攻による夜間哨戒に従事．6月美保に移動．終戦で解隊．

偵察第707飛行隊

昭和20年3月偵察第3飛行隊を一式陸攻装備の夜間哨戒隊に改編，改称．沖縄戦で夜間攻撃・哨戒に従事．5月美保に移動し終戦．

偵察第709飛行隊

昭和20年3月木更津で編成．752空所属の夜間偵察隊．一式陸攻装備で4月鹿屋に進出，801空の指揮を受け機雷敷設や夜間哨戒に従事するも短期間で壊滅．5月解隊．